Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Smim19Q80ZU4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Smim19Q80ZU4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Smim19Q80ZU4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Smim19Q80ZU4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Smim19Q80ZU4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Smim19Q80ZU4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Smim19Q80ZU4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Smim19Q80ZU4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim19Q80ZU4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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