Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ6

Abcc12, Multidrug resistance-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc12Q80WJ6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcc12Q80WJ6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms