Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup214Q80U93 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup214Q80U93 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms