Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms