Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms