Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNV1

Fam57b, Protein FAM57B, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam57bQ7TNV1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam57bQ7TNV1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam57bQ7TNV1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms