Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shq1Q7TMX5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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