Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms