Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim12Q78RX3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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