Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms