Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sned1Q70E20 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms