Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms