Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc3bQ6PDC0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms