Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd3Q6P9Z1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms