Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnpQ6P8I4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnpQ6P8I4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnpQ6P8I4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnpQ6P8I4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnpQ6P8I4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnpQ6P8I4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnpQ6P8I4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnpQ6P8I4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcnpQ6P8I4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcnpQ6P8I4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcnpQ6P8I4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcnpQ6P8I4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PcnpQ6P8I4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnpQ6P8I4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms