Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms