Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo27Q6DIA9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo27Q6DIA9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo27Q6DIA9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo27Q6DIA9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo27Q6DIA9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo27Q6DIA9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo27Q6DIA9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo27Q6DIA9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo27Q6DIA9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo27Q6DIA9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxo27Q6DIA9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxo27Q6DIA9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxo27Q6DIA9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxo27Q6DIA9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxo27Q6DIA9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo27Q6DIA9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms