Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms