Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pram1Q6BCL1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms