Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Gm20854Q62461 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Gm20854Q62461 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Gm20854Q62461 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Gm20854Q62461 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Gm20854Q62461 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gm20854Q62461 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm20854Q62461 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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