Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm20809Q62458 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm20809Q62458 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm20809Q62458 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20809Q62458 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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