Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms