Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RhocQ62159 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RhocQ62159 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RhocQ62159 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RhocQ62159 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RhocQ62159 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhocQ62159 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhocQ62159 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhocQ62159 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhocQ62159 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhocQ62159 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RhocQ62159 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms