Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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