Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms