Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms