Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms