Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms