Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ItgaeQ60677 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms