Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd5Q5VCS6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms