Protein–RNA interactions for Protein: Q5U419

Mfsd3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd3Q5U419 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd3Q5U419 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd3Q5U419 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms