Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms