Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fam71bQ5STT6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms