Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms