Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms