Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Syce1lQ5D525 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Syce1lQ5D525 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Syce1lQ5D525 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Syce1lQ5D525 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Syce1lQ5D525 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Syce1lQ5D525 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1lQ5D525 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms