Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Slc27a5Q4LDG0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Slc27a5Q4LDG0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc27a5Q4LDG0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Slc27a5Q4LDG0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Slc27a5Q4LDG0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Slc27a5Q4LDG0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Slc27a5Q4LDG0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Slc27a5Q4LDG0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Slc27a5Q4LDG0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Slc27a5Q4LDG0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Slc27a5Q4LDG0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc27a5Q4LDG0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms