Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms