Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga4Q3UW12 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga4Q3UW12 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga4Q3UW12 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga4Q3UW12 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga4Q3UW12 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga4Q3UW12 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga4Q3UW12 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga4Q3UW12 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga4Q3UW12 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms