Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skap2Q3UND0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms