Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tmem253Q3UNB8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tmem253Q3UNB8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Tmem253Q3UNB8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Tmem253Q3UNB8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tmem253Q3UNB8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tmem253Q3UNB8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tmem253Q3UNB8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tmem253Q3UNB8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tmem253Q3UNB8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tmem253Q3UNB8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tmem253Q3UNB8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tmem253Q3UNB8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem253Q3UNB8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tmem253Q3UNB8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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