Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ell2Q3UKU1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms