Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nom1Q3UFM5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms