Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms