Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm21440Q3TTD8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21440Q3TTD8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21440Q3TTD8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21440Q3TTD8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm21440Q3TTD8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21440Q3TTD8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21440Q3TTD8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21440Q3TTD8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21440Q3TTD8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21440Q3TTD8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm21440Q3TTD8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm21440Q3TTD8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm21440Q3TTD8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21440Q3TTD8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21440Q3TTD8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm21440Q3TTD8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm21440Q3TTD8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm21440Q3TTD8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Gm21440Q3TTD8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm21440Q3TTD8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm21440Q3TTD8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm21440Q3TTD8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21440Q3TTD8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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