Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHK6

Gsdmc2, Gasdermin-C2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsdmc2Q2KHK6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsdmc2Q2KHK6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsdmc2Q2KHK6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms