Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Traf3ip1Q149C2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Traf3ip1Q149C2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3ip1Q149C2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3ip1Q149C2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3ip1Q149C2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3ip1Q149C2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3ip1Q149C2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Traf3ip1Q149C2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3ip1Q149C2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3ip1Q149C2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3ip1Q149C2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3ip1Q149C2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3ip1Q149C2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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