Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim24Q0VG18 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim24Q0VG18 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms