Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms