Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms